OMIM 601987 - Carnitina palmitoltrasferasi muscolare; CPT1B

Altre denominazioni e acronimi
CPT IB
CPT I, MUSCOLARE
MCCPT1
KIAA1670

Locus della mappa genica 22qter

TESTO

DESCRIZIONE

The mitocondriali carnitina palmitoyltransferases (CPTs; EC 2.3.1.21) sono richiesto to allow net trasporto di catena lunga grassi acil-CoAs dalla citoplasma dentro i mitocondri per ossidazione beta. Type I CPT risiede nei membrana mitocondriale esterna (Yamazaki ed altri, 1996). CPT1B è specifici ai muscoli scheletrici, CPT1A (600529) è specifici to fegato, e CPT1C (608846) è specifici to cervello (Ji ed altri, 2008).

CLONAZIONI

A least 2 isoforme di tipo I CPT sono espressa negli umani e ratto. Yamazaki ed altri (1996) usato un cDNA probe per the ratto muscoli-tipo CPT I to isolate cloni di cDNA per l'omologa umana. By Northern analisi, esse determinarono che questo isoforma è espressa principalmente nel cuore e neimuscoli scheletrici.

Van der Leij ed altri (1997) isolata e sequenziarono cDNA e genomica DNA frammenti del umani CPT1B gene, codificante muscoli tipo carnitina palmitoiltrasferasi I. Le analisi di CPT1B cDNA sequenze rilevarono la presenza di una non traslate 5-prime esone e differenziale processing di introni 13 e 19. The alternative splicing di introne 13 causate un in-frame delezione portante to una proteina più piccole by 10 amino acidi. By usando differenti splice accettore siti, van der Leij ed altri (1997) trovò che introne 19 era splicciato nella maggior parte casi, ma 4 di 14 sequenziarono CPT1B 3-prime cloni di cDNA contenevano parte di introne 19 instead dell'esone 20.

By RT-PCR di umani cuore e muscoli scheletrici mRNA, Yamazaki ed altri (2000) identificarono fusione trascritti nel quale 3-prime esoni dalla upstream colina chinasi-beta (CHKB; 612395) gene erano splicciato to o esone 1A o esone 2 del MCPT1 gene.

STRUTTURA GENICA

By l'analisi della sequenza genomica, Yamazaki ed altri (1997) determinarono che the CPT1B gene contiene 21 esoni, della quale 18 sono codificante, e si estende approssimativamente 10 kb. Il primo 2 esoni, esoni 1A e 1B, sono non codificante e alternativamente splicciato. Le analisi del 5-prime affiancano la regione rilevarono che the CHKB gene è solo 314 bp upstream dalla esone 1A.

MAPPATURA

Con la fluorescenza ad ibridazione in situ usando a ricombinante P1 fago contenente CPT1B, van der Leij ed altri (1997) mappato il gene nel cromosoma 22qter. Questo indicavano che the 'fegato tipo' (CPT1A) e 'muscoli tipo' isoforme di CPT I sono codificato by differenti loci. (CPT1A mappa to 11q.) Con la fluorescenza ad ibridazione in situ, Britton ed altri (1997) mappato the CPT1B gene nel cromosoma 22q13.3.

MODELLO ANIMALE

Ji ed altri (2008) trovò che omozigote Cpt1b carenza in topo era embrionici letali prima embrionici giorno 9.5 to 11.5. Heterozygous topo appariva normale, ma eterozigote femmine in a eterozigote breeding pair aveva diminuzione numbers di fetuses, suggerendo che the femmine erano o meno predisponenti to conceive o più predisponenti to undergo aborto spontaneo. Cpt1b attività in muscoli di eterozigote topo andava dalla 55 to 60%. Heterozygous topo mostrò diminuzione freddo tolleranza e aumentava fatale hypothermia dopo a freddo-challenge test compararono al tipo selvatico. Ji ed altri (2008) notarono che i ritrovamenti erano coerenti con the scarsezza di umani casi di omozigote CPT1B carenza.

RIFERIMENTI

1. Britton, C. H.; Mackey, D. W.; Esser, V.; Foster, D. W.; Burns, D. K.; Yarnall, D. P.; Froguel, P.; McGarry, J. D. :: Fine cromosoma mappatura del geni per umani fegato e carnitina muscolare palmitoiltrasferasi I (CPT1A e CPT1B). Genomics 40: 209-211, 1997.
PubMed ID : 9070950
2. Ji, S.; You, Y.; Kerner, J.; Hoppel, C. L.; Schoeb, T. R.; Chick, W. S. H.; Hamm, D. A.; Sharer, J. D.; Wood, P. A. :: Homozygous carnitina palmitoiltrasferasi 1b (muscoli isoforma) carenza è letali nei topo. Molec. Genet. Metab. 93: 314-322, 2008.
3. van der Leij, F. R.; Takens, J.; van der Veen, A. Y.; Terpstra, P.; Kuipers, J. R. G. :: Localization e introne usage analisi del umani CPT1B gene per muscoli tipo carnitina palmitoiltrasferasi I. Biochim. Biophys. Acta 1352: 123-128, 1997.
PubMed ID : 9199240
4. Yamazaki, N.; Shinohara, Y.; Kajimoto, K.; Shindo, M.; Terada, H. :: Novel espressione di equivocal messages contenente entrambi regioni di colina/ethanolamine chinasi e muscoli tipo carnitina palmitoiltrasferasi I. J. Biol. Chem. 275: 31739-31746, 2000.
PubMed ID : 10918069
5. Yamazaki, N.; Shinohara, Y.; Shima, A.; Yamanaka, Y.; Terada, H. :: Isolazione e caratterizzazione di cDNA e genomica cloni codificante umani muscoli tipo carnitina palmitoiltrasferasi I. Biochim. Biophys. Acta 1307: 157-161, 1996.
PubMed ID : 8679700
6. Yamazaki, N.; Yamanaka, Y.; Hashimoto, Y.; Shinohara, Y.; Shima, A.; Terada, H. :: Structural caratteristiche del gene codificante umani muscoli tipo carnitina palmitoiltrasferasi I. FEBS Lett. 409: 401-406, 1997.
PubMed ID : 9224698

COLLABORATORI

Patricia A. Hartz - aggiornato : 11/10/2008
Cassandra L. Kniffin - aggiornato : 9/10/2008
Paul J. Converse - aggiornato : 10/10/2001
Lori M. Kelman - aggiornato : 1/30/1998

DATA DI INIZIO

Victor A. McKusick : 9/11/1997

REVISIONI

mgross : 11/10/2008
wwang : 9/11/2008
ckniffin : 9/10/2008
carol : 8/6/2002
mgross : 10/10/2001
terry : 4 giugno 1998
dholmes : 1/30/1998
dholmes : 1/30/1998
dholmes : 1/30/1998
dholmes : 1/30/1998
mark : 9/11/1997
terry : 9/11/1997