Testo ancora in corso di traduzione di Natale Marzari

Dopo 41 anni e 5 mesi, nel maggio 2006 la magistratura di Trento ha riconosciuto l'esistenza e la gravità di quella malattia rara che nessuna altra istituzione o persona singola della provincia di Trento ancora mi riconosce, e per negare la quale mi perseguita.
Natale Marzari
 
*608451 Esami genetici
GENE ETE1; ETHE1

Altre denominazioni e acronimi

HEPATOMA SUBTRACTED CLONE ONE; HSCO
D83198

Locus della mappa genica 19q13.32

CONTENUTO

CLONAZIONI

Higashitsuji ed altri (2002) identificarono il gene HSCO come una nuova proteina espressa in epatoma che accelera l'esportazione di NFKB (vedere 164011) dal nucleo e inibisce l'apoptosi dipendente da p53 (191170). Con mappatura per omozigosità e analisi genomiche integrative, Tiranti ed altri (2004) identificarono HSCO, conosciuto anche come D83198 (GenBank D83198) come il gene nel cromosoma 19q13 responsabile per encefalopatia etilmalonica (602473) quando mutato. Essi rinominarono il gene ETHE1 in considerazione della sua relazione con la malattia. La proteina ETHE1 è una proteina filogeneticamente conservata che condivide un alto grado di omologia con GLO2 (138760). Le analisi Northern blot mostrarono l'espressione ubiquitaria della ETHE1 come un singolo trascritto di 1.000 nucleotidi approssimativamente. La proteina contiene una sequenza terminale N di 24 aminoacidi i cui residui mostrno similarità a quelli dei principali peptidi mitocondriali. La proteina ETHE1 è mirata ai mitocondri e internalizzata dentro la matrice dopo la segmentazione dipendente dall'energia del peptideprincipale. 30 PubMed Neighbors

STRUTTURA GENICA

Tiranti ed altri (2004) determinarono che il gene ETHE1 contiene 7 esoni.

GENETICA MOLECOLARE

Con una combinazione di mappatura per omozigosità, integrazione di basi di dati genomici fisici e funzionali, e vagliatura per mutazioni, Tiranti ed altri (2004) identificarono il gene ETHE1 e la mutazione che è responsabile per encefalopatia etilmalonica (EE; 602473), una malattia metabolica infantile devastante nella quale si rivelano alti livelli di acido etilmalonico neil fluidi corporei, e l'attività della citocromo c ossidasi è diminuita nei muscoli scheletrici. La grave conseguenze dei loro malfunzionamenti indica un importante ruolo del prodotto del gene ETHE1 nella omeostasi e nel metabolismo energetico mitocondriale. Tiranti ed altri (2004) mostrarono che il gene ETHE1 è localizzato in 19q13 con la mappatura per collegamento. Dalle caratteristiche cliniche e biochimiche della EE, essi assunsero che la proteina responsabile è probabile sia coinvolta nel metabolismo mitocondriale. Poi escludendo i 2 tipi conosciuti di geni che mappano in 19q13, selezionarono i geni candidati dalle proteine previst con funzione sconosciuta, le quali possono potenzialmente essere coinvolte nei mitocondri. Per questo, seguirono un approccio genomico integrato che era stato originalmente sviluppato (Mootha ed altri, 2003) per identificare la LRPPRC (607544), le mutazioni nelle quali sono responsabili per 1 forma della carenza di citocromo c ossidasi (220111). In accordo con questa strategia, venne dato un 'indice dei neighborhood' a tutti i geni della regione critica; questo indice rifletteva le similarità delle loro RNA espressione profili a quelle of conosciute mitocondriale geni. Through sequenziazione del 7 esoni del gene ETHE1, Tiranti ed altri (2004) trovato mutazioni omozigote in tutti probandi dal 4 famiglie consanguinee originalmente usata per gene mappatura, come pure in una quinta famiglia originalmente presunta non consanguinei. Il probando in una sesto famiglia era a composizione eterozigote. Mutazioni erano anche trovato in 8 aggiuntive probandi belonging to 4 consanguineo e 2 non consanguinei famiglie, come pure in 4 non imparentati singleton pazienti. Most del 16 mutazioni differenti erano perdita-of-funzione mutazioni producenti a stop, a frameshift, o aberrante splicing. In una famiglia consanguinea, l'intera gene era mancante, e in 2 altri, esone 4 era mancante in entrambi alleli. Essi scoprirono 6 mutazioni missenso, tutti predicendo aminoacidi cambia in altamente conservata posizione. 30 PubMed Neighbors

Even though encefalopatia etilmalonica è stata descritta principalmente in famiglie dal Mediterranean basin e the penisola arabica, Tiranti ed altri (2004) ottennero nessuna evidenza di l'esistenza di un aplotipo ancestrale o Un insieme of mutazioni comuni nei loro cohort dei pazienti con EE. Poiché the rapporto iniziale, no più che 30 casi di EE era stata descritta worldwide, portante all'assunzione che EE è una molto rare malattia. Comunque, la reale incidenza of questa malattia could sono state significativamente sottostimata perché il fenotipo biochimico era incorrettamente attribuito ad altre malattie metaboliche, particolarmente difetti del mitocondriale flavoproteina trasferitrice di elettroni percorso. 30 PubMed Neighbors

VARIANTI ALLELICHE
(esempi selezionati)

.0001 ETILMALONICA ENCEFALOPATIA [ETHE1, ARG163TRP] Review this SNP

In un paziente con encefalopatia etilmalonica (602473) da un famiglia consanguinea, Tiranti ed altri (2004) trovato a 487C-T transizione nell'esone 4 del gene ETHE1, previsti to result in un arg163-to-trp scambio di amminoacidi (R163W). la stessa mutazione missenso vennero trovate in 2 altre non imparentati probandi. La aplotipi in queste casi differiva from ogni altre, suggerendo che la mutazione event avvenne either indipendentemente o in una molto ancient comune progenitori. 30 PubMed Neighbors

.0002 ETILMALONICA ENCEFALOPATIA [ETHE1, MET1ILE]

In un paziente con encefalopatia etilmalonica (602473) da un famiglia consanguinea, Tiranti ed altri (2004) trovato un cambiamento del codone di iniziazione from ATG (met) to ATT (ile).

.0003 ETILMALONICA ENCEFALOPATIA [ETHE1, 1-BP INS, 604G]

In un paziente con encefalopatia etilmalonica (602473) da un famiglia consanguinea, Tiranti ed altri (2004) identificarono una inserzione da 1-bp, 604_605insG, nell'esone 6 del gene ETHE1, previsti to result in frameshift e premature terminazione (V202fsX220).

.0004 ETILMALONICA ENCEFALOPATIA [ETHE1, TYR74TER ]

In un paziente con encefalopatia etilmalonica (602473) da un non consanguinei famiglia, Tiranti ed altri (2004) trovato eterozigosi composta per una 221_222insA mutazione nell'esone 2 del gene ETHE1 ed una 440_450del11 mutazione nell'esone 4. Questo mutazioni erano state previste to result in trascritti cambia tyr74-to-stop (Y74X) e H147fsX176, rispettivamente. la stessa Y74X mutazione vennero trovate in omozigote state in un'altra paziente. 30 PubMed Neighbors

.0005 ETILMALONICA ENCEFALOPATIA [ETHE1, 440_450DEL11 ]

Vedere (608451.0004) e Tiranti ed altri (2004).

RIFERIMENTI

1. Higashitsuji, H.; Higashitsuji, H.; Nagao, T.; Nonoguchi, K.; Fujii, S.; Itoh, K.; Fujita, J. :
Una nuova proteina sovraespressi in epatoma accelera l'esportazione di NF-kappa B dal nucleo e inibisce p53-l'apoptosi dipendente da. Cancer Cell 2: 335-346, 2002.
PubMed ID : 12398897

 

2. Mootha, V. K.; Lepage, P.; Miller, K.; Bunkenborg, J.; Reich, M.; Hjerrild, M.; Delmonte, T.; Villeneuve, A.; Sladek, R.; Xu, F.; Mitchell, G. A.; Morin, C.; Mann, M.; Hudson, T. J.; Robinson, B.; Rioux, J. D.; Lander, E. S. :
Identificazione di un gene umano causante carenza di citocromo c ossidasi con la genomica integrativa. Proc. Nat. Acad. Sci. 100: 605-610, 2003.
PubMed ID : 12529507

 

3. Tiranti, V.; D'Adamo, P.; Briem, E.; Ferrari, G.; Mineri, R.; Lamantea, E.; Mandel, H.; Balestri, P.; Garcia-Silva, M.-T.; Vollmer, B.; Rinaldo, P.; Hahn, S. H.; Leonard, J.; Rahman, S.; Dionisi-Vici, C.; Garavaglia, B.; Gasparini, P.; Zeviani, M. :
L'encefalopatia etilmalonica è causata da mutazioni in ETHE1, un gene codificante una proteina della  matrice mitocondriale. Am. J. Hum. Genet. 74: 239-252, 2004.
PubMed ID : 14732903

DATA DI CREAZIONE

Victor A. McKusick : 6 febbraio 2004

REVISIONI

carol : 26 agosto 2005
alopez : 10 febbrao 2004
alopez :9 febbraio 2004

Copyright © 1966-2008 Johns Hopkins University


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