Altre denominazioni e acronimi
PROTEINA RICCA DI LEUCINA, 130-KD; LRP130
Locus della mappa genica
2p21-p16
CONTENUTO
CLONAZIONI
Usando anticorpi contro la proteina di legame a lectina da 130-kD,
Hou ed altri (1994) clonarono LRPPRC, che loro chiamarono LRP130, da una
genoteca di espressione di cDNA HepG2. La proteina dedotta di 1.273 aminoacidi ha
una massa molecolare calcolata di130 kD. Due codoni di iniziazione putativi
alternati della traslazione
codificano proteine di 137 e 131 kD. La LRPPRC contiene 167
residui di leucina che sono dispersi ogni 15 - 19
aminoacidi attraverso la proteina, assommanti a
circa il 13% della sequenza. La metà terminale N della LRPPRC è ricca di cisteina.
La LRPPRC ha 4 siti di glicosilazione collegati al potenziale N, una sequenza che condividono
in omologia con il sito legante ad ATP della chinasi dipendente dalla ATP, ed una proteina chinasi C
sito della fosforilazione (vedere
176960). Non ha una sequenza
segnale secretoria o domini idrofobici. Le analisi Northern blot su cellule HepG2 rivelarono espressione di
un trascritto maggiore di 4,8-kb e trascritti minori di
5,2 e 7,0 kb. Le analisi Western blot di cellule con COS-1
trasferite transientemente rivelarono una doppietta con una
massa molecolare apparente di circa 130 kD.
Liu e McKeehan (2002) notarono che il terminale N della LRPPRC contiene molteplici copie di
segnali nucleari di trasporto ricchi di leucina seguiti da una epsina (607262), regione (ENTH)
omologa al terminale N, e SEC1, omologa ai domini estendentisi attraverso il terminale C.
I domini ENTH sono più comunemente associati con le proteine
coinvolte nella endocitosi e nella organizzazione citoscheletrica, e i domini SEC1 sono solitamente coinvolti
nel trasporto delle vescicole. Le analisi Northern blot
confermarono la presenza dei trascritti della LRPPRC da
4,8, 5,2, e 7,0 kb in tutti tessuti esaminati. L'espressione era più alta nel cuore,
nei muscoli
scheletrici, nei reni, e nel fegato, intermedia nel
cervello, nel colon non mucoso, nella milza, e nella placenta, e più bassa
nell'intestino tenue, nel timo, nei polmone, e
nei leucociti del sangue periferico.
FUNZIONE GENICA
Con analisi di 2 ibridi di lievito,
Liu e McKeehan (2002) determinarono che il dominio SEC1
della LRPPRC interagisce con C19ORF5 (607573),
UXT (300234),
C6ORF34 (605825),
e CECR2 (607576).
Notando le funzioni putative di questi partner leganti,
Liu e McKeehan (2002) ipotizzarono che la LRPPRC
ha un ruolo regolatorio che integra il citoscheletro con il traffico vesicolare,
gli scambi nucleocitosolici, la trascrizione, il rimodellamento dei cromosomi, e
la citocinesi.
STRUTTURA GENICA
Mootha ed altri (2003) determinarono che il gene
LRPPRC contiene 38 esoni e spazia una
lunghezza genomica totale di 100 kb approssimativamente.
MAPPATURA
Con analisi delle sequenze genomiche,
Mootha ed altri (2003) mapparono il gene LRPPRC
al cromosoma 2p21-p16.
GENETICA MOLECOLARE
Mootha ed altri (2003) identificarono la LRPPRC
come un gene candidato per la sindrome di Leigh di tipo franco-canadese (220111),
una forma della carenza di citocromo c ossidasi. Essi sequenziarono tutti 38 gli esoni del gene LRPPRC in 2
pazienti, 1 genitore, e 1 controllo non imparentato e
identificarono una mutazione missenso, da ala354 a val
(A354V;
607544.0001), in un residuo conservato negli umani,
topi, ratti, e fugu.
Mootha ed altri (2003) genotiparono più pazienti, e
su 22 pazienti totali, 21 erano omozigoti per la mutazione
A354V e 1 era eterozigote. Come ci si aspettava,
la mutazione A354V era eterozigote in 31 dei 32
genitori esaminati e non era presente nei 175 controlli non
imparentati. Il solo paziente il quale era
eterozigote per la mutazione A354V era eterozigote
per l'aplotipo a rischio fondatore. Ragionando che dovrebbe essere portatore di una
seconda distinta mutazione,
Mootha ed altri (2003) vagliarono tutti 38 gli esoni
di questo paziente e identificarono una delezione da 8 bp nell'esone 35 provocante uno
stop prematuro all'amminoacido 1.277 (607544.0002).
Comunque, questo paziente era a composizione
eterozigote. La stessa delezione nell'esone 35 venne identificata in sua madre ma
in nessuno dei 350
controlli non imparentati.
.0001 SINDROME DI LEIGH, FRANCO-CANADESE TIPO
[LRPPRC, ALA354VAL]
In 21 su 22 pazienti franco-canadesi con la
sindrome di Leigh (220111),
Mootha ed altri (2003) identificarono
omozigosità per una transizione C-a-T al nucleotide
1119 nell'esone 9 del gene LRPPRC, provocante una mutazione da
ala354 a val (A354V). L'altro paziente
era a composizione eterozigote per A354V e per una delezione da 8 bp nell'esone 35 (607544.0002).
.0002 SINDROME DI LEIGH, FRANCO-CANADESE TIPO
[LRPPRC, 8-BP DEL, esone 35 ]
In 1 su 22 pazienti con la sindrome di Leigh di tipo franco-canadese (220111),
Mootha ed altri (2003) identificarono
eterozigosi composta per la mutazione maggiore da ala354a a val (A354V;
607544.0001) del gene LRPPRC ed una delezione da 8 bp
nell'esone 35, provocante uno stop prematuro all'amminoacido 1.277.
RIFERIMENTI
- 1. Hou, J.; Wang, F.; McKeehan, W. L. :
- Clonazione molecolare e espressione del gene
per una proteina più ricca di leucina da cellule di epatoblastoma
umano (HepG2). In
Vitro Cell Dev. Biol. 30A: 111-114, 1994.
- 2. Liu, L.; McKeehan, W. L. :
- Le analisi sequenziali della LRPPRC e del suo dominio
SEC1 e l'interazione con i partner suggerisce un ruolo nella organizzazione citoscheletrica,
il traffico vescicolare, lo scambio nucleocitosolico, e
l'attività cromosomica. Genomics 79:
124-136, 2002.
PubMed ID :
11827465
- 3. Mootha, V. K.; Lepage, P.; Miller, K.;
Bunkenborg, J.; Reich, M.; Hjerrild, M.;
Delmonte, T.; Villeneuve, A.; Sladek, R.; Xu,
F.; Mitchell, G. A.; Morin, C.; Mann, M.;
Hudson, T. J.; Robinson, B.; Rioux, J. D.;
Lander, E. S. :
- Identificazione di un gene umano causante
carenza di citocromo c ossidasi con la genomica integrativa. Proc. Nat. Acad. Sci.
100: 605-610, 2003.
PubMed ID :
12529507
COLLABORATORI
Patricia A. Hartz - aggiornamento : 24 febbraio
2003
Victor A. McKusick - aggiornamento : 12 febbraio 2003
DATA DI CREAZIONE
Patricia A. Hartz : 5 febbraio 2003
REVISIONI
terry : 20 luglio 2004
mgross : 15 luglio 2003
mgross : 3 luglio 2003
mgross : 24 febbraio 2003
mgross : 24 febbraio 2003
mgross : 14 febbraio 2003
terry : 12 febbraio 2003
mgross : 5 febbraio 2003
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