Altre denominazioni e acronimi
POLG, ACCESSORY SUBUNITA' ACCESSORIA
POLG-BETA; POLGBLocus della mappa genica
17q23-q24
CONTENUTO
DESCRIZIONE
L'accuratezza della duplicazione del DNA mitocondriale (mtDNA) dipende dall'azione coordinata
di
molte proteine codificate dal nucleo e dal corretto equilibrio dei nucleotidi dentro la matrice mitocondriale.
Lo mtDNA è replicato dalla DNA
gamma-polimerasi, la quale è composta di una subunità catalitica da 140-kD (POLG1;
174763) ed una subunità accessoria da 55-kD (POLG2).
CLONAZIONI
Con ricerche in un database EST usando la sequenza dedotta degli aminoacidi
della subunità Polg beta della Drosophila- come query,
Wang ed altri (1997) identificarono un cDNA umano
codificante POLG2, che loro chiamarono POLG-beta. La proteina dedotta 3di 72-aminoacidi POLG2
condivide il 31% di identità degli aminoacidi con l'omologa da
361-aminoacidi della Drosophila; una leucina zipper
motivo nel POLG2 terminale C condividono 55% identità. In
its middle porzione, comunque, the umano POLG2
proteina ha a zinc-legante signature sequenza
piuttosto che a zinc finger motivo like the
Drosophila proteina.
Carrodeguas e Bogenhagen (2000) stabilirono che la POLG2 sequenza riportata da
Wang ed altri (1997) lacks un terminale N
localizzazione mitocondriale segnale in comparazione
con Xenopus Polg2. Con ricerche in un database EST per
sequenze con omologia al terminale N of Xenopus
Polg2 e usando a PCR-basate clonazione strategia, they
isolata un cDNA codificante una putative 485-aminoacidi
umano POLG2 proteina, che loro chiamarono POLG2B.
Le analisi sequenziali mostrava che questa POLG2
clone contiene 2 frameshifts con rispetto to la sequenza riportata da
Wang ed altri (1997), e the codificato proteina
contiene un a monte 25-aminoacidi localizzazione mitocondriale segnale. Titration esperimenti usando
batteri-prodotto POLG2 mostrava che a slight eccesso
of POLG2 è richiesti per massimale stimolazione of
POLG1 attività. Le analisi immunoblot dimostrarono che
ricombinante e mitocondriale POLG2 copurify con POLG1
e che POLG2 è espresso come un approssimativamente
54-kD proteina.
Carrodeguas e Bogenhagen (2000) notarono che
POLG2 è altamente omologhi to class II
amminoacil-tRNA sintetasi (vedere EPRS;
138295).
STRUTTURA GENICA
Longley ed altri (2006) stabilirono che il gene POLG2 comprende 8 esoni codificanti.
MAPPATURA
Longley ed altri (2006) stabilirono che il gene POLG2 mappa al cromosoma 17q.
CARATTERISTICHE BIOCHIMICHE
Carrodeguas ed altri (2001) determinarono the
crystal struttura of topo Polgb, a core componente
del mitocondriale duplicazione meccanismo. Essi
trovarono che Polgb mostra alto similarità to
glycyl-tRNA sintetasi (GARS;
600287) e dimerizes attraverso un inusuale
intermolecolari 4-elica bundle. Una umano POLGB mutante
mancanti the 4-elica bundle failed to dimerize in
solution o to stimulate la subunità catalitica
POLGA, ma it mantenga la capacità to bind con POLGA
in una primer-template construct, indicanti che la
funzionale oloenzima contiene 2 POLGB molecole.
Altre mutanti mantenga stimulatory attività ma lost
la capacità to bind folded a corda singola DNA.
Questi risultati suggerì che la POLGB dimer
contiene distinta siti per POLGA legante,
dimerization, e DNA legante.
GENETICA MOLECOLARE
basati on the essenziali ruolo del p55 subunità accessoria per altamente processive mtDNA sintesi e
enhanced DNA legante delle DNA polimerasi G
oloenzima,
Longley ed altri (2006) vagliarono il gene POLG2
per mutazioni in 101 pazienti con l'oftalmoplegia esterna progressiva (PEO). Essi trovato una mutazione eterozigote (G451E;
604983.0001) in 1 paziente. La malattia (PEOA4;
610131) si pensò molto probabilmente avere arisen
attraverso aploinsufficienza o eterodimerizzazione
del mutato e di tipo selvatico proteine, la quale
promuovano delezioni del mtDNA by stalling the DNA
duplicazione fork. La progressive accumulazione delezioni del mtDNA causa
carenza di COX nei fibre muscolari e risulta nel fenotipo clinico.
.0001 OFTALMOPLEGIA ESTERNA PROGRESSIVA CON
DELEZIONI DEL DNA MITOCONDRIALE, AUTOSOMICA
DOMINANTE, 4 [POLG2, GLY451GLU]
In una paziente con tipiche a tarda insorgenza
oftalmoplegia esterna progressiva (PEOA4;
610131),
Longley ed altri (2006) trovato a eterozigoti
1352G-A (gly451 to glu; G451E) mutazione nel gene POLG2. Biochemical caratterizzazione of purificato,
ricombinante G451E-substituted p55 proteina in vitro
rivelarono incomplete stimolazione del subunità catalitica dovuta a compromessa subunità interazione.
Sebbene G451E p55 mantenga a di tipo selvatico
ability to bind DNA, it failed to aumenta
DNA-legante forza del p140-p55 complesso.
RIFERIMENTI
- 1. Carrodeguas, J. A.; Bogenhagen, D. F. :
- Protein sequenze conservato in
procariotici amminoacil-tRNA sintetasi sono
importante per l'attività del processivity
fattore del DNA mitocondriale umano
polimerasi.
Nucleic Acids Res. 28: 1237-1244,
2000.
PubMed ID :
10666468
- 2. Carrodeguas, J. A.; Theis, K.;
Bogenhagen, D. F.; Kisker, C. :
- Crystal struttura e delezione analisi
mostrano che la subunità accessoria dei mammiferi DNA
gamma-polimerasi, Pol-gamma-B, funzioni come a
omodimero. Molec. Cell 7: 43-54,
2001.
PubMed ID :
11172710
- 3. Longley, M. J.; Clark, S.; Man, C. Y. W.;
Hudson, G.; Durham, S. E.; Taylor, R. W.;
Nightingale, S.; Turnbull, D. M.; Copeland, W.
C.; Chinnery, P. F. :
- Mutante POLG2 distrugge la
subunità della DNA gamma-polimerasi e causa oftalmoplegia esterna progressiva.
Am. J. Hum. Genet.
78: 1026-1034, 2006.
PubMed ID :
16685652
-
- 4. Wang, Y.; Farr, C. L.; Kaguni, L. S. :
- Accessory subunità del DNA mitocondriale
polimerasi dalla drosofila embrioni: clonazione,
analisi molecolari, e associazione nel native
enzima. J. Biol. Chem. 272:
13640-13646, 1997.
PubMed ID :
9153213
COLLABORATORI
Anne M. Stumpf - aggiornamento : 18 maggio 2006
Victor A. McKusick - aggiornamento : 15 maggio 2006
Stylianos E. Antonarakis - aggiornamento : 1 febbraio 2001
DATA DI CREAZIONE
Paul J. Converse : 22 maggio 2000
REVISIONI
alopez : 18 maggio 2006
alopez : 18 maggio 2006
terry : 15 maggio 2006
mgross : 1 febbraio 2001
carol : 8 giugno 2000
mgross : 22 maggio 2000
Copyright © 1966-2008 Johns Hopkins University
