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FATTORE 1 RESPIRATORIO NUCLEARE; NRF1

Locus della mappa genica 7q32

CONTENUTO

DESCRIZIONE

Gopalakrishnan e Scarpulla (1995) notarono che la catena di trasporto degli elettroni e nel sistema della fosforilazione ossidativa rely on the funzionale interplay of gene prodotti espresso di entrambi nuclear e genoma mitocondriale. Poiché del limitati codificanti capacità del cromosoma mitocondriale, geni nucleari must fornendo most del respiratoria subunità e tutti del gene prodotti necessario per del DNA mitocondriale trascrizione e duplicazione. Nuclear respiratoria fattore-1 (NRF1) è una fattore di trascrizione che agisce on geni nucleari codificante respiratoria subunità e componenti del mitocondriale trascrizione e duplicazione meccanismo.

CLONAZIONI

Virbasius ed altri (1993) clonarono the umano NRF1 cDNA from cellule HeLa usando degenerate primers basate on parziale tryptic peptide sequenze e mostrava a previsti 504 aminoacidi proteina codificato da una 2,970 nucleotide cDNA. La recombinantly espresso proteina attivato trascrizione di numerosi NRF1-responsive promotore.

La NRF1 fattore di trascrizione lega to 2 palindromic siti entro the promotore del eIF-2-alfa (603907) gene e è essenziali per eIF-2-alfa trascrizione. Efiok ed altri (1994) clonarono umano cDNAs codificante NRF1, che loro chiamarono alfa-Pal. Le analisi sequenziali indicavano che alfa-Pal è una putative bZIP fattore di trascrizione con forte omologia to orche marine P3A2 e Drosophila ewg, developmental fattori di trascrizione. analisi Northern blot rivelarono che alfa-Pal era espresso come 2.4- e 3.4-kb mRNAs in tutti tessuti umani provarono, con la strongest espressione nei muscoli scheletrici.

In studi del espressione del NRF1 gene in coltivate umano fibroblasti, Spelbrink e Van den Bogert (1995) identificarono 2 distinta NRF1 trascritti usando RT-PCR, 1 della quale conteneva un in-frame delezione of 198 bp. Il sequenziamento of genomici DNA mostrava che la shorter mRNA è il risultato di alternative splicing, con esone skipping. La shorter trascritti era previsti to result in un isoforma della proteina che lacks the carboxy-terminale parti del DNA legante dominio, la quale they speculato might influenzano trascrizionale attivazione by normale nuclear respiratoria fattore 1. La alternativamente spliced trascritti era anche presente in altre umano linee cellulari e nei numerosi tessuti umani. A quantitative l'analisi PRC mostrava che la percentages del alternativamente spliced trascritti andava dal 3 to 17%. Gli autori ulteriori speculato che differenze nel percentuale of alternativamente spliced NRF1 pre-mRNA may influenzano biogenesi mitocondriale under variabile fisiologiche conditions e può giocare un ruolo in distinta malattie mitocondriali.

FUNZIONE GENICA

Efiok ed altri (1994) identificarono geni contenenti alfa-Pal-legante sequenze e trovarono che queste poteva essere classificati either come cellulare proliferazione geni, o come geni regulating the crescita-responsive metabolica percorsi of energia transduction, traslazione, e duplicazione. Gli autori proposero che alfa-Pal è una fattore di trascrizione che links the trascrizionale modulazione of chiave metabolica geni to cellulare crescita e sviluppo.

Virbasius e Scarpulla (1994) notarono che la codificati dal nucleo fattore di trascrizione mitocondriale TFAM (600438) contiene potenziale siti di legame per NRF1, NRF2 (GABPA; 600609) e SP1 (189906) entro the promotore regione. With use of legante e elettroforetica mobilità shift campioni, DNase footprinting, e mutazione analisi of ricombinante proteine, essi dimostrarono specifica e funzionale legante of NRF1 e NRF2 al TFAM promotore regione. Methylation del guanine nucleotidi nel tandem GCGC motivi interfered con NRF1 legante. With use of reporter constructs e mutazione analisi, they determinarono che NRF1 ha a più robust effetti on TFAM promotore attività che NRF2 o SP1. Ulteriori, attivazione by NRF2 o SP1 richiesti la presenza di un funzionale NRF1-legante site.

Wang ed altri (2006) trovarono che topo cyclin D1 (CCND1; 168461) repressed l'espressione e attività of Nrf1 via fosforilazione a ser47.

STRUTTURA GENICA

Gopalakrishnan e Scarpulla (1995) isolata e caratterizzata il gene umano codificante NRF1. La NRF1 gene spazia approssimativamente 65 kb e ha 11 esoni e 10 introni che gamma da in dimensione from 0.8 to 15 kb. Gli autori notarono che queste analisi devono essere utile in evaluating the potenziale ruolo of NRF1 nelle malattie mitocondriali provocante da difetti nel nuclear controllo of mitocondriale funzione.

MAPPATURA

Gopalakrishnan e Scarpulla (1995) analizzarono DNA da un panel of umano/criceto cellule ibridi usando umano-specifica NRF1 PCR primers e localizzata the NRF1 gene al cromosoma umano 7. La AssegnaziUna era ulteriori raffinata to 7q31 by cohybridization of NRF1- e cromosoma 7-specifica probes to umano metaphase cromosomi. Tiranti ed altri (1995) mapparono the NRF1 gene to 7q32 con l'ibridizzazione a fluorescenza in situ. (Essi riportava al gene come NFE2L1; questo symbol aveva already been reserved per the NF-E2-correlati fattore 1 (163260).)

RIFERIMENTI

1. Efiok, B. J. S.; Chiorini, J. A.; Safer, B. :

A chiave fattore di trascrizione per eucariotiche iniziazione fattore-2-alfa è fortemente omologhi to developmental fattori di trascrizione e may collegamento metabolica geni to cellulare crescita e sviluppo. J. Biol. Chem. 269: 18921-18930, 1994.
PubMed ID : 8034649

 

2. Gopalakrishnan, L.; Scarpulla, R. C. :

Struttura, espressione, e cromosomica Assegnazione del gene umano codificante nuclear respiratoria fattore 1. J. Biol. Chem. 270: 18019-18025, 1995.
PubMed ID : 7629110

 

3. Spelbrink, J. N.; Van den Bogert, C. :

La pre-mRNA of nuclear respiratoria fattore 1, a regolatore of biogenesi mitocondriale, è alternativamente spliced in tessuti umani e linee cellulari. Hum. Molec. Genet. 4: 1591-1596, 1995.
PubMed ID : 8541844

 

4. Tiranti, V.; Rossi, E.; Rocchi, M.; DiDonato, S.; Zuffardi, O.; Zeviani, M. :

il gene (NFE2L1) per umano NRF-1, un attivatore coinvolto in nuclear-mitocondriale interazioni, mappa a 7q32. Genomics 27: 555-557, 1995.
PubMed ID : 7558044

 

5. Virbasius, C. A.; Virbasius, J. V.; Scarpulla, R. C. :

NRF-1, un attivatore coinvolto in nuclear-mitocondriale interazioni, utilizes Una nuova DNA-legante dominio conservato in una famiglia of developmental regulators. Genes Dev. 7: 2431-2445, 1993.
PubMed ID : 8253388

 

6. Virbasius, J. V.; Scarpulla, R. C. :

Attivazione del umano fattore di trascrizione mitocondriale A gene by nuclear respiratoria fattori: a potenziale regolatorio collegamento fra nuclear e gene mitocondriale espressione in organelle biogenesi. Proc. Nat. Acad. Sci. 91: 1309-1313, 1994.
PubMed ID : 8108407

 

7. Wang, C.; Li, Z.; Lu, Y.; Du, R.; Katiyar, S.; Yang, J.; Fu, M.; Leader, J. E.; Quong, A.; Novikoff, P. M.; Pestell, R. G. :

Cyclin D1 repression of nuclear respiratoria fattore 1 integra DNA nucleare sintesi e mitocondriale funzione. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 11567-11572, 2006.
PubMed ID : 16864783

COLLABORATORI

Patricia A. Hartz - aggiornamento : 3 ottobre 2006
Patricia A. Hartz - aggiornamento : 28 giugno 2002
Rebekah S. Rasooly - aggiornamento : 17 giugno 1999
Alan F. Scott - aggiornamento : 27 marzo 1996

DATA DI CREAZIONE

Victor A. McKusick : 19 ottobre 1995

REVISIONI

mgross : 9 ottobre 2006
terry : 3 ottobre 2006
carol : 28 giugno 2002
alopez : 17 giugno 1999
alopez : 17 giugno 1999
mgross : 15 marzo 1999
terry : 4 giugno 1998
terry : 17aprile 1996
mark : 27 marzo 1996
mark : 19 ottobre 1995

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