*190315
FAMIGLIA DEI 25 PORTATORI DI SOLUTI (PORTATORI MITOCONDRIALI, TRASPORTATORE DI CITRATO), MEMBRO 1; SLC25A1

Locus della mappa genica 22q11

CONTENUTO

Il trasportatore mitocondriale dei tricarbossilati (chiamato anche proteina di trasporto del citrato, o CTP) è responsabile per il movimento del citrato attraverso la membrana mitocondriale interna. Usando una PCR-amplificato su una frazione di cDNA di CTP, Kaplan ed altri (1993) isolarono e sequenziarono un clone di cDNA che codifica l'intero polipeptide della CTP. Essi trovarono che le CTP condividono la sequenza motivo specifica mostrata da altri trasportatori mitocondriali. Le analisi Southern blot di entrambi i genomi dei DNA di ratto e umano dimostrarono la presenza di  sequenze multiple correlate al trasportatore di tricarbossilati.

Heisterkamp ed altri (1995) localizzarono un gene umano CTP nella regione critica (o cromosomica) di DiGeorge (DGCR) in 22q11 (188400). Sulla base dell'alto grado di omologia con il gene di ratto per la proteina trasportatrice mitocondriale di citrato  precedentemente isolato, si pensò che rappresenti il gene CTP umano. Gli autori specularono che, sebbene sembri improbabile che l'emizigosità del CTP umano giochi un ruolo maggiore nello sviluppo della sindrome di DiGeorge e nella sindrome velocardiofacciale (VCFS; 192430), tale di emizigosità potrebbe contribuire alla carenza mentale dei pazienti.

L'analisi GRAIL (riconoscimento del gene ed analisi dei collegamenti Internet; Uberbacher e Mural, 1991) è un algoritmo di calcolo realizzato in parte per distinguere fra regioni codificanti e non codificanti e per assemblare gli esoni previsti in un gene. Goldmuntz ed altri (1996) usarono GRAIL per mappare il gene per la CTP umana in 22q11 dentro la DGCR, la quale spazia approssimativamente 1,2 Mb e contiene una stima di 30 geni. Ricerche in database usando una sequenza genomica dal DGCR identificarono similarità in una proteina di trasporto dei tricarbossilati mitocondriali di roditore nella stessa regione dove GRAIL prevedeva un gruppo di esoni. Il trasportatore mitocondriale di tricarbossilati CTP è una proteina mitocondriale transmembranale ed è prevista avere 6 eliche alfa membrano-tensive idrofobiche intervallate da 5 segmenti idrofilici. Goldmuntz ed altri (1996) clonarono l'omologo umano del CTP di roditore e determinarono la sua struttura genomica ed il modello dell'espressione. Analisi Northern blots su tessuti umani adulti rivelarono abbondante espressione in molti tessuti, compreso il fegato, i testicoli, le ovaie, e l'intestino, ma non nel cervello, nei muscoli scheletrici, o nei polmoni. Essi scoprirono anche una espressione relativamente alta nel cervello, nei polmoni, nel fegato, e nei reni fetali. Il gene è simbolizzato anche come SLC20A3.

Stoffel ed altri (1996) mapparono il gene SLC20A3 al cromosoma 22 analizzando la sua segregazione in un panel di cellule somatiche ibride umano/criceto. La assegnazione venne confermata e raffinata in 22q11.21 con l'ibridizzazione a fluorescenza in situ.

Iacobazzi ed altri (1997) determinarono la sequenza e la struttura del gene del trasportatore di citrato umano. Essi trovarono che si espande per 2,8 kb del DNA ed è suddiviso in 8 esoni. Sei dei 7 introni sono localizzati entro sequenze codificanti le anse extramembraniche, piuttosto che nei segmenti transmembranali della CTP. La griglia di lettura aperta codifica una proteina matura di 298 aminoacidi e una presequenza di 13 aminoacidi che aiuta ad indirizzare la proteina ai mitocondri. E' stata determinata la sequenza di 2 pseudogeni umani.

RIFERIMENTI

1. Goldmuntz, E.; Wang, Z.; Roe, B. A.; Budarf, M. L. :

Clonazione, organizzazione genomica, e localizzazione cromosomica della proteina di trasporto del citrato umana alla regione critica della sindrome minimale velocardiofacciale di DiGeorge. Genomics 33: 271-276, 1996.
PubMed ID : 8660975
 

2. Heisterkamp, N.; Mulder, M. P.; Langeveld, A.; ten Hoeve, J.; Wang, Z.; Roe, B. A.; Groffen, J. :

Localizzazione del gene della proteina trasportatrice mitocondriale di citrato umano al cromosoma 22q11 nella regione critica per la sindrome di DiGeorge. Genomics 29: 451-456, 1995.
PubMed ID : 8666394
 

3. Iacobazzi, V.; Lauria, G.; Palmieri, F. :

Organizzazione e sequenza del gene umano per la proteina di trasporto del citrato mitocondriale. DNA Seq. 7: 127-139, 1997.
PubMed ID : 9254007
 

4. Kaplan, R. S.; Mayor, J. A.; Wood, D. O. :

La proteina di trasporto dei tricarbossilati mitocondriali: clonazione del cDNA, struttura primaria, e comparazione con altre proteine mitocondriali di trasporto. J. Biol. Chem. 268: 13682-13690, 1993.
PubMed ID : 8514800
 

5. Stoffel, M.; Karayiorgou, M.; Espinosa, R., III; Le Beau, M. M. :

Il gene del trasportatore mitocondriale di citrato umano (SLC20A3) mapatto alla sezione cromosomica 22q11 dentro una regione implicata nelle sindromi di DiGeorge sindrome, velo-cardio-facciale e schizofrenia. Hum. Genet. 98: 113-115, 1996.
PubMed ID : 8682495
 

6. Uberbacher, E. C.; Mural, R. J. :

Localizzate le regioni codificanti la proteina nelle sequenze del DNA umano con un approccio multiplo a rete sensorio-neurale. Proc. Nat. Acad. Sci. 88: 11261-11265, 1991.
PubMed ID : 1763041

COLLABORATORI

Victor A. McKusick - aggiornamento : 31 marzo 1998

DATA DI CREAZIONE

Victor A. McKusick : 18 agosto 1993

REVISIONI

cwells : 12 novembre 2003
psherman : 29 luglio 1998
carol : 12 maggio 1999
psherman : 31 marzo 1998
terry : 26 marzo 1998
jenny : 31 marzo 1997
mark : 12 settembre 1996
mark : 19 giugno 1996
terry : 11 giugno 1996
terry : 7 maggio 1996
terry : 7 maggio 1996
terry : 30 aprile 1996
terry : 22 aprile 1996
mark : 25 ottobre 1995
carol : 18 agosto 1993

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