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Testo ancora in corso di traduzione di Natale Marzari

Dopo 41 anni e 5 mesi, nel maggio 2006 la magistratura di Trento ha riconosciuto l'esistenza e la gravità di quella malattia rara che nessuna altra istituzione o persona singola della provincia di Trento ancora mi riconosce, e per negare la quale mi perseguita.
Natale Marzari
 
*185620 Esami genetici
SURFEIT 1; SURF1
Locus della mappa genica 9q34


TESTO

La topo surfeit gene gruppo contiene 6 chiusamente spaced geni domestici, denominati Surf1 to Surf6, non imparentati by sequenza omologia (Williams ed altri, 1988; Colombo ed altri, 1992). No più che 73 paia di basi separate ogni 2 del 4 ben caratterizzato surfeit gruppo geni. Williams ed altri (1988) trovarono che juxtaposition di 4 dei geni era conservato nel umano surfeit gene gruppo. Colombo ed altri (1992) trovarono che tight clustering e juxtaposition di almeno 5 del surfeit geni, numerate 1 attraverso 5, e loro associato CpG-ricca isole sono conservato over the 600 milioni di anni di divergenti evoluzione che separates birds e mammiferi. Essi suggerirono che surfeit rappresenta a differenti forma di gene gruppo nella quale gene organizzazione possano giocare entrambi una positiva ed una negative regolatorio ruolo nell'espressione del gene, possibilmente via cis interazioni fra the chiusamente spaced geni. 30 PubMed Neighbors

La prima 2 esoni del umano SURF3 (185640) gene sono state trovato essere capaci di attivante the TRK oncogene (164970). La SURF3 gene appare essere il solo introne-contenenti membro della famiglia. Giallongo ed altri (1989) dimostrarono che la SURF3 gene codifica the L7a proteina ribosomale. Con metodi di nucleic acido ibridizzazione usando cellule somatiche ibride e con l'ibridazione in situ, Yon ed altri (1989) localizzata the umano surfeit gene gruppo al cromosoma bands 9q33-q34. Un altro attivo umano proteina ribosomale gene che è stato mappato è S14 (130620). Usando un interspecies backcross, Stubbs ed altri (1990) mapparono il surfeit e Hox-5 gene insiemi al prossimale porzione di topo cromosoma 2. Surf è chiuse al protooncogene Abl, vicino alla centromero di topo cromosoma 2. Yon ed altri (1993) confermarono la localizzazione del surfeit gruppo in 9q34 con l'ibridizzazione a fluorescenza in situ e mostrava che la organizzazione e juxtaposition del umano surfeit locus geni sono la stessa come nel topo. Ulteriori, analisi con la FISH di metaphase spreads dalla umano cronica mieloidi cellule leucemiche contenenti the t(9;22)(q34;q11) traslocazione comprendenti the ABL gene (189980) a 9q34.1 e acute nonlymphocytic cellule leucemiche contenenti the t(6;9)(p23;q34) traslocazione comprendenti the CAN gene (114350) a 9q34.1 dimostrarono che la surfeit gruppo è telomeric to queste 2 geni. Colombo ed altri (1992) trovarono che la chiuse clustering del surfeit locus geni e loro associato CpG-ricca isole è conservato persino nel polli, la quale è separato by 600 milioni di anni di divergenti evoluzione dalla mammiferi. Yon ed altri (1993) commentarono che tuberous sclerosi-1 (191100) e nail-patella sindrome (NPS1; 161200) sono distale to ABL. La coinvolgimento di surfeit geni in queste malattie awaited studio. 30 PubMed Neighbors

Usando PCR e SSCP analisi, Mor ed altri (1996) descrissero a polimorfismo nel surfeit locus del gene. Questo polimorfismo avvenne con alto frequenza. Mor ed altri (1996) notarono che questa polimorfismo è di interesse sino it avvienenel TSC1 regione a 9q34 (vedi 191100). Con ricerche GenBank con la riportarono primer, Smith (1997) trovarono che la polimorfismo riportarono da Mor ed altri (1996) è dovuta ad una mutazione nel SURF3 gene (RPL7A; 185640). 30 PubMed Neighbors

sindrome di Leigh (256000), conosciuta anche come Encefalopatia necrotizzante subacuta infantile (SNE), è una grave malattia neurologica caratterizzata da bilateralmente simmetriche lesioni necrotiche in subcorticale regioni del cervello che è comunemente associato con carenza sistemica della citocromo c ossidasi (COX) (220110). carenza di COX è un autosomica recessiva tratto, e la maggior parte dei pazienti appartengono to un singolo complementazione genetica gruppo. Usando trasferimento di cromosomi mediato da microcellule, Zhu ed altri (1998) mapparono il difetto genetico in carenza di COX to 9q34 by complementazione della carenza nella catena respiratoria in paziente fibroblasti. SURF1 divenne a posizionale gene candidato. Le analisi di SURF1 rivelarono numerosi mutazioni, tutti della quale previsti una proteina tronca. I risultati suggerivano una ruolo per SURF1 nella biogenesi del complesso COX e definito Una nuova classe di difetti dei geni umano causante neurodegenerativa malattia. 30 PubMed Neighbors

Nella mappatura fatto by trasferimento di cromosomi mediato da microcellule, Zhu ed altri (1998) trasferito tutti 22 autosomes e the cromosoma X, una a a time, dentro un paziente fibroblasti line, ad avere dimostrato correzione del difetto metabolico by cromosoma 9. To refine the mappa posizione del difettoso gene nel cromosoma 9, Zhu ed altri (1998) introducendo deleta versions del cromosoma 9. La localizzaziUna era avvicinarono ulteriori by escludendo regioni di 9q by use del DNA marcatori in 2 piccole famiglie. 30 PubMed Neighbors

Zhu ed altri (1998) mostrava che la carenza di COX poteva essere 'recuperava' by SURF1 cDNA in paziente fibroblasti. Essi suggerirono che la approccio di complementazione funzionale could serve come a paradigma per mappare e clone altre geni nucleari associato con malattie della catena respiratoria, tipo la mtDNA sindrome da deplezione (251880) o complesso I-carente sindrome di Leigh (252010). 30 PubMed Neighbors

Tiranti ed altri (1998) usata complementazione campioni basate sulla fusione della citocromo c ossidasi-negative malattia di Leigh linee cellulari con numerosi roditore/umano ibride cellule che era stato made rho(0), per es., deprived dei loro mtDNA by prolungato esposizione to alto dosi di ethidium bromide, per identificare una COX negative malattia di Leigh locus. Complementazione del COX difetto venne ottenuta solo con roditore/umano rho(0) ibridi che conteneva cromosoma umano 9. Le analisi collegate ristretto il locus della malattia al subtelomeric regione di 9q, entro le 7-cM intervallo fra marcatori D9S1847 e D9S1826. Essi sought mutazioni in geni candidati nella regione, includendo SURF1, il lievito omologo (SHY1) della quale codifica una proteina mitocondriale necessario per il mantenimento dell'attività COX e respirazione. Tiranti ed altri (1998) trovarono che SURF1 era mutato nel probandi di 9 COX negative malattia di Leigh famiglie; nel probandi di 6 famiglie, perdita-di-funzione mutazioni vennero trovati in entrambi alleli. 30 PubMed Neighbors

Usando anticorpi contro a ricombinante, chiamarono SURF1 proteina in COS-7 cellule, Tiranti ed altri (1999) dimostrarono che la proteina è importate dentro i mitocondri come a più grandi 35-kD precursore la quale è poi processato dentro the mature 30 kD prodotto delle cleaving off di un 40-aminoacidi terminale N leader polipeptide. analisi Western blot mostrava che SURF1 è localizzata in e strettamente legato al membrana mitocondriale interna. Cell linee con perdita-di-funzione mutazioni SURF1 non aveva rintracciabile proteina e no SURF1 trascritti, suggerendo grave mRNA instabilità. Due-dimensional gel elettroperesi esperimenti on SURF1 mutante e controllo linee cellulari mostrava che COX assemblaggio in SURF1 mutanti era bloccava a un precoce passo, molto probabilmente prima the incorporazione delle subunità II nel nascent intermedi composti delle subunità I da sola o subunità I più subunità IV. 30 PubMed Neighbors

Poyau ed altri (2000) studiarono fibroblasti da 3 pazienti sofferenze per la sindrome di Leigh associato con carenza di citocromo c ossidasi. Their del DNA mitocondriale era funzionale e tutti subunità nucleai COX aveva normale sequenze. La espressione di trascritti mitocondriale codificante e subunità nucleai COX era normale o leggermente aumentati. Similarmente, the OXA1 (601066) trascritti codificanti per una proteina coinvolto nell'assemblaggio della COX era aumentati. Comunque, numerosi COX-proteina subunità erano gravemente depressed, indicanti carente COX assemblaggio. Le analisi sequenziali di SURF1 in queste 3 pazienti rivelarono 7 eterozigoti mutazioni, 6 della quale erano nuovi: un inserzione, una mutazione nonsenso, a splicing mutazione a introne 7, e 3 mutazioni missenso. La gly124-to-glu mutazione (185620.0012) cambiando a gli che è strettamente conservato in Surf1 omologhi di 12 specie. 30 PubMed Neighbors

Pequignot ed altri (2001) stabilirono che 30 mutazioni differenti in SURF1 erano state riportate in 40 pazienti non imparentati. Twenty mutazioni era stata descritta solo Una volta. La maggior frequente mutazione coinvolto una delezione di 10 bp e un inserzione di 2 bp (AT) (185620.0003); questa mutazione vennero trovate in 12 di 40 pazienti, e era omozigote in 3 di loro. Il secondo la maggior parte delle frequente mutazione era una delezione di 2 bp, CT alla posizione 845-846 (185620.0014); questa mutazione vennero trovate in 9 di 40 pazienti. 30 PubMed Neighbors

In 18 di 24 (75%) pazienti con carenza di COX LS, Tiranti ed altri (1999) identificarono 13 mutazioni differenti nel gene SURF1. Tutti del mutazioni, includendo frameshift, nonsenso, e mutazioni nel sito di splice, erano state previste to risultato in perdita di proteina funzione. Non vennero mutazioni identificate missenso. Inoltre, no mutazioni SURF1 vennero trovati in 6 pazienti con carenza di COX classificati come 'simil-Leigh' o in 16 pazienti con carenza di COX classificati come 'non-LS.' Tiranti ed altri (1999) conclusero che mutazioni SURF1 sono specificamente associato con LS e che SURF1 è il gene responsabili per la maggior parte dei casi di carenza di COX nella LS. 30 PubMed Neighbors

In 3 casi con LS con carenza di COX, Moslemi ed altri (2003) identificarono 4 mutazioni patogeniche nel gene SURF1, includendo 2 nuove mutazioni. In tutti casi, i pazienti' fibroblasti mostrava ridotta L'attività COX, che venne ristabilito dopo trasfezione con normale SURF1 cDNA.

MODELLO ANIMALE

Agostino ed altri (2003) realizzarono a topo knockout costitutivo per SURF1. Postimpiantazione letalità embrionica colpiti 90% di Surf1 -/- omozigoti; approssimativamente 30% di nati vivi animali morì entro la prima postnatale mese, e un aggiuntive 15% morì entro la prima 6 mesi di età. Significant deficit nei muscoli perza e motori perpermance veniva osservata, senza ovvie anormalità in cervello morfologia o aperti sintomi neurologici. A profondo e isolata difetto dell'attività COX nei muscoli scheletrici e fegato venne trovato, e ridotta reazione istochimica to COX e proliferazione mitocondriale nei muscoli scheletrici era presente. 30 PubMed Neighbors

VARIANTI ALLELICHE
(esempi selezionati)

.0001 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 765C-T ]

In un paziente con la sindrome di Leigh (256000), Zhu ed altri (1998) identificarono eterozigosi composta per una 765C-T mutazione nonsenso nell'esone 7 ed una 337+2T-C mutazione nel donatore sito di splice dell'introne 4 del gene SURF1.

.0002 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, IVS4, T-C, +2]

Vedere 185620.0001 e Zhu ed altri (1998). La donatore sito di splice mutazione porta a delezione dell'esone 4; questo appariva derivare dal use di un cryptic donatore sequenza (GT) alla l'estremità 5-prime dell'esone 4, la quale causata the rimuove dell'esone e introne 4 quando the di tipo selvatico donatore consenso sequenza nell'introne 4 era mutato. 30 PubMed Neighbors

.0003 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 2-BP INS/10-BP DEL, NT326]

In un paziente con la sindrome di Leigh (256000), Zhu ed altri (1998) identificarono eterozigosi composta per un inserzione/delezione mutazione nell'esone 4 (326insATdelTCTGCCAGCC), la quale realizzarono a nonsenso codone nel sito della mutazione, ed una 2 bp delezione nell'esone 9 la quale rimosso 1 del 3 CT ripetizioni fra posizione 855 e 860. La latter mutazione era denominati 855delCT. Poyau ed altri (2000) trovato questa mutazione in eterozigosi composta con una gly124-to-glu mutazione (185620.0012). 30 PubMed Neighbors

.0004 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 2-BP DEL, 855CT]

Vedere 185620.0003 e Zhu ed altri (1998).

.0005 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 1-BP INS, 882T]

In un paziente con la sindrome di Leigh (256000), Zhu ed altri (1998) trovato omozigosità per inserzione di un T dentro a string di Ts, creante a nonsenso codone. La mutazione era denominati 882insT. Questo e altre 4 mutazioni trovato by Zhu ed altri (1998) in casi della sindrome di Leigh previsti una proteina tronca prodotto. 30 PubMed Neighbors

.0006 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, GLN251TER ]

In loro famiglia G con la sindrome di Leigh (256000), Tiranti ed altri (1998) trovato omozigosità per una 751C-T transizione nell'esone 7 del gene SURF1, provocante una cambiamento dalla gln per fermare a codone 251.

Tiranti ed altri (1999) riportarono gemelle monozigote con la sindrome di Leigh come risultato di ereditarietà di questa mutazione attraverso unigenitoriale disomia di materna cromosoma 9.

.0007 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 1-BP INS, 868T ]

In loro famiglia C con la sindrome di Leigh (256000), Tiranti ed altri (1998) trovato omozigosità per una frameshift dovuta a inserzione di un T dopo nucleotide 868 nell'esone 9 del gene SURF1.

.0008 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, IVS5DS, T-G, +2 ]

In loro famiglia B con la sindrome di Leigh (256000), Tiranti ed altri (1998) trovarono che COX negative sindrome di Leigh era associato con eterozigosi composta per una splice mutazione ed una frameshift delezione: 516+2T-G nell'esone 5 e delezione di AG dopo nucleotide 550 nell'esone 60.

.0009 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 2-BP DEL, 550AG ]

Vedere 185620.0008 e Tiranti ed altri (1998).

.0010 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, TYR274ASP ]

In una giapponese paziente con la sindrome di Leigh (256000), Teraoka ed altri (1999) trovato eterozigosi composta per mutazioni nel gene SURF1: a T-to-G trasversione al nucleotide 820, provocante una tyr274-to-asp sostituzione, ed una 2 bp delezione al nucleotide 790 (185620.0011). Il paziente era the discendenti di genitori non consanguinei . Dalla dell'età di di 10 mesi, il paziente mostrava neurologici segni e sintomi, a partire con danneggiamento di movimenti. All'età di 14 mesi, he could no più a lungo crawl. All'età di 17 mesi, his altezza e peso erano far al di sotto normale. All'età di 18 mesi, riflessi tendinei erano ipoattivi e intentional tremore degli arti sviluppato. C'erano anormalità motorie oculari, includendo saccadi lente e bilaterale interno strabismo. Respiratory insufficienza gradualmente sviluppato, necessitando intermittenti ventilazione assistita. Le immagini a risonanza magnetica mostrava bilaterale, simmetriche segnale aumento in gangli basali, cerebello dentate nucleo, e attorno the aqueduct del mesencefalo. Cerebrospinal liquidi lattato e acido piruvico concentrazioni erano elevati. Comunque, lattato ematico e acido piruvico concentrazioni non erano elevati. On biopsia muscolare, no mitocondriale alterazioni vennero trovati, e nessuno del 3 del mutazioni del DNA mitocondriale associato con la sindrome di Leigh venne trovato. L'attività enzimatica di COX era diffusamente e gravemente diminuita nei muscoli, e no L'attività COX era demonstrable nel vasi sanguigni, periferica nervi, e fibroblasti. 30 PubMed Neighbors

.0011 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 2-BP DEL, 790AG]

CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI

Vedere 185620.0010 e Teraoka ed altri (1999).

Rahman ed altri (2001) descrissero una bambina di 2 anni, nata da sani, bengalesi consanguinei genitori, la quale presentava con crescita insufficiente, globale neuroregressione nello sviluppo, e acidosi lattica. MRI del cervello mostrava leucodistrofia con coinvolgimento del tratto corticospinale. Non c'erano lesioni dei gangli basali necrotiche caratteristica della sindrome di Leigh. Respiratory catena enzima campioni sulla biopsia muscolare rivelarono una grave carenza isolata di COX (220110). Le analisi sequenziali del gene SURF1 mostrava omozigosità per una 2 bp delezione a nucleotidi 790-791. I genitori della paziente erano eterozigoti. Gli autori suggerirono l'esaminazione degli enzimi della catena respiratoria in pazienti con leucodistrofia e acidosi lattica e sequenziamento SURF1 in pazienti con carenza isolata di COX. 30 PubMed Neighbors

.0012 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, GLY124GLU ] Review this SNP

Poyau ed altri (2000) identificarono una 385G-A transizione nel gene SURF1 previsti per causare a gly124-to-glu (G124E) scambio di amminoacidi. I genitori non erano imparentati. Il paziente mostrava normale precoce motori e intellettuali pietre miliari ma sviluppato una malattia neurologica progressiva con motori e intellettuali regressione portante in una fatale encefalopatia. Il paziente era a composizione eterozigote; l'altro allele erano portatori a 2 bp inserzione/10-bp delezione (185620.0003). 30 PubMed Neighbors

.0013 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 4-BP INS, 572CCCT ]

In una 10- anni ragazzo con un insolitamente lieve decorso clinico della sindrome di Leigh (256000), Salviati ed altri (2004) trovato eterozigosi composta per mutazioni nel gene SURF1. A 4 bp inserzione (CCCT) al nucleotide 572 dell'esone 6, che venne associato con una comune polimorfismo (573C-G) sulla stessa allele, causata a previsti premature terminazione segnale 7 codoni a valle. Gli altri mutazione era una delezione di 10-bp ed una inserzione di 2 bp nell'esone 4 (185620.0003). Sua madre era portatrice della mutazione nell'esone 4 e suo padre era portatore della mutazione nell'esone 6. All'età di 39 mesi, il paziente non aveva lesioni MRI; a 8 anni di età, MRI mostrava solo tronco cerebrale e cerebellare coinvolgimento senza lesioni nei gangli basali o nuclei subtalamici. Salviati ed altri (2004) conclusero che lo spettro dei ritrovamenti MRI nella sindrome di Leigh è variabile e che mutazioni SURF1 devono essere considerarono in pazienti con encefalopatia e carenza di COX persino quando i primi risultati della MRI sono negative. 30 PubMed Neighbors

.0014 SINDROME DI LEIGH DOVUTA A CARENZA DI CITOCROMO c OSSIDASI [SURF1, 2-BP DEL, 845CT ]

In 9 di 40 pazienti non imparentati con la sindrome di Leigh dovuta alla carenza di citocromo c ossidasi (256000), Pequignot ed altri (2001) identificarono una 2 bp delezione nel gene SURF1 (845delCT).

Bohm ed altri (2006) trovarono che la 845delCT mutazione era la più comune mutazione SURF1 in 47 pazienti dalla 35 famiglie con la sindrome di Leigh e carenza di citocromo c ossidasi (vedi 220110) dovuto una mutazione SURF1. La delezione era presente in 89% di indipendente alleli.

RIFERIMENTI

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21. Zhu, Z.; Yao, J.; Johns, T.; Fu, K.; De Bie, I.; Macmillan, C.; Cuthbert, A. P.; Newbold, R. F.; Wang, J.; Chevrette, M.; Brown, G. K.; Brown, R. M.; Shoubridge, E. A. :
SURF1, codificante un fattore coinvolto nella biogenesi della citocromo c ossidasi, è mutato nella sindrome di Leigh. Nature Genet. 20: 337-343, 1998.
PubMed ID : 9843204

COLLABORATORI

Cassandra L. Kniffin - aggiornamento : 30 maggio 2007
George E. Tiller - aggiornamento : 4 gennaio 2005
Marla J. F. O'Neill - aggiornamento : 20 luglio 2004
Cassandra L. Kniffin - aggiornamento : 29 febbraio 2004
Cassandra L. Kniffin - aggiornamento : 9 luglio 2003
Deborah L. Stone - aggiornamento : 24 novembre 2001
Victor A. McKusick - aggiornamento : 25 giugno 2001
Michael J. Wright - aggiornamento : 5 maggio 2000
Victor A. McKusick - aggiornamento : 8 marzo 2000
Victor A. McKusick - aggiornamento : 13 gennaio 2000
Victor A. McKusick - aggiornamento : 11 gennaio 1999
Victor A. McKusick - aggiornamento : 24 novembre 1998
Moyra Smith - aggiornamento : 2 gennaio 1997

DATA DI INIZIO

Victor A. McKusick : 8/29/1989

REVISIONI

wwang : 6 giugno 2007
ckniffin : 30 maggio 2007
ckniffin : 30 maggio 2007
terry : 22 febbraio 2005
alopez : 4 gennaio 2005
carol : 26 agosto 2004
carol : 22 luglio 2004
terry : 20 luglio 2004
ckniffin : 29 febbraio 2004
carol : 10 luglio 2003
ckniffin : 10 luglio 2003
ckniffin : 9 luglio 2003
carol : 24 novembre 2001
mcapotos : 6 luglio 2001
mcapotos : 29 giugno 2001
terry : 25 giugno 2001
alopez : 5 maggio 2000
mcapotos : 6 aprile 2000
mcapotos : 3 aprile 2000
terry : 8 marzo 2000
mgross : 21 febbraio 2000
terry : 13 gennaio 2000
psherman : 9/14/1999
carol : 20 gennaio 1999
carol : 19 gennaio 1999
carol : 15 gennaio 1999
terry : 11 gennaio 1999
alopez : 11 dicembre 1998
alopez : 8 dicembre 1998
alopez : 30 novembre 1998
terry : 24 novembre 1998
terry : 24 novembre 1998
dkim : 16 luglio 1998
terry : 7 luglio 1997
mark : 2 gennaio 1997
carol : 23 dicembre 1993
carol : 26 aprile 1993
carol : 10 settembre 1992
carol : 18 agosto 1992
supermim : 16 marzo 1992
carol : 11 giugno 1990

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