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Traduzione di Natale Marzari Home, Cerca, Indice alfabetico, Collegamenti, Patologia, Molecole, Sindromi, Muscoli, Giunzioni neuromuscolari, Nervi, Spinale, Atassia, Anticorpi e Biopsia, Informazioni per i pazienti   Monday 29 September 2008
Dopo 41 anni e 5 mesi, nel maggio 2006 la magistratura di Trento ha riconosciuto l'esistenza e la gravità di quella malattia rara che nessuna altra istituzione o persona singola della provincia di Trento ancora mi riconosce, e per negare la quale mi perseguita.  Natale Marzari

Splicing mRNA

Splicing Pre-mRNA

• Struttura dei geni del DNA
  • Esoni 
    • Internal esoni media 145 nucleotides nei lunghezza
    • Anche contengono regolatore elements
      • Richiesta per efficient splicing of constitutive e alternative esoni
      • Differenti sets of auxiliary e regolatore elements usata by differenti geni
      • Tipi
        • ESEs: Esoneic splicing enhancers
        • ESSs: Esoneic splicing silencers
  • Introni
    • Media più than 10x più lunga than esoni
    • Anche contengono regolatore elements
      • Modulate cellule-specifico use of alternative esoni
      • Agisce by legante multicomponent regolatore complessies
      • Tipi
        • ISEs: Intronic splicing enhancers
        • ISSs: Intronic splicing silencers
  • Siti splice
    • Localizzazione: At intron/esone borders
    • Tipi
      • 5' sito di splice
        • Sequenza: AGguragu
        • U1 snRNP: Legami alla 5' sito di splice
      • 3' sito di splice
        • Sequenza: yyyyyyy nagG (y= pyrimidine)
      • Branch site
        • Sequenza: ynyuray (r = purine)
        • U2 snRNP: Legami alla branch site via RNA:RNA interazioni fra snRNA e pre-mRNA
    • Struttura: Breve; Contiene tipiche "degenerate" sequenze
• Generale funzioni of pre-mRNA splicing
  • Removal of Introni
  • splicing alternativo
    • Definizione: Joining of differenti 5' e 3' Siti splice
    • Caratteristiche generali
      • ~80% of splicing alternativo Risultano nei cambiamenti nel codificato proteina
      • Fino ai 59% of umana geni espressa più than un mRNA by splicing alternativo
    • Effetti funzionali: Generates numerosi Forma of mRNA dal singolo gene
    • Permette functionally diverse proteina Isoforme to be espresso according to differenti regolatore programs
    • Strutturali effetti: Insert o remove aminoacidi; Shift reading frame;; Introduce terminazione codone
    • Espressione genetica effetti: Rimuove o inserts regolatore elements controlling translation, mRNA stabilità, o localizzazione
    • Regolazione
      • Cell specifico
      • Splicing percorsi modulated according to: Tipo di cellule; sviluppomental stage; Gender; esterne stimolo

Spliceosomes¹

Spliceosomi: Generale Localizzazione: Nucleo funzione Process pre-mRNA by splicing out intronic nucleic acidi producente mRNA which è then traslato to proteina nei ribosomes Meccanismi di azione Ritrovamento della intron/esone boundaries Via splice sequenze e multipla altre debole signals Catalysis of cut-e-paste reazioni that remove Introni e join esoni Contenente Five sottili nucleari RNAs (snRNAs o U(uridine-ricchi di)-RNAs) Ogni snRNA è associata con specifico fattori complessi Forma a sottili nucleari ribonucleoprotein Particelle (snRNP) Proteine: > 100 snRNP componenti Namesake snRNA (per es. U1 snRNP ha U1 snRNA) snRNP RNAs: U1 ; U2 ; U4; U5; U6 Differisce dal mRNAs nei cap struttura: 2,2,7-trimethyl guanosine "Smith" (SM) core proteine comuni to tutti snRNPs B e B' , D1 , D2 , D3 , E , F, G legame AU4-6G sequenza legame snRNA primi Obiettivi of autoanticorpi (anti-Sm) nei sistemico lupus Maggiore obiettivi: Sm-B/B' e D proteine Anticorpi precipitate U1, U2, U4/U6 e U5 particles snRNP-specifico proteine U1: 70k , A , C Obiettivo of selettiva autoanticorpi (anti-nRNP) In miste malattia del tessuto connettivo Proteina bersglio solitamente U1-70k o U1A U2: A' , B'' Obiettivo of autoanticorpi nei scleroderma U5: 25K, 1BP Cervello specifico: SNRNP-N Altro SMN: Deficiente nei spinali muscolare atrofia SIP1 (Gemina 2): Interagisce con SMN Funzionale ruoli per each snRNP U1 Inizialmente bound to 5'-sito di splice Rilasciata on recruitment of U4/U5/U6 ? Determina which 5'-sito di splice è usata U2 Inizialmente lega branchPuntiforme riconoscimento sequenza Forma due duplexes con U6 Brings intron 5'-sito di splice close to the branchPuntiforme U4 Inizialmente Complessata con U5 e U6 Keeps U6 nei un unfolded conFormation Rilasciata dopo delivering U6 to the 5'-sito di splice ? U6 chaperone U5 Inizialmente Complessata con U4 e U6 Lega esone sequenze Localizzazione Upstream of 5'-sito di splice Downstream of 3'-sito di splice ? Guide sequenza per holding esoni insieme U6 Inizialmente Complessata con U4 e U5 Displaces U1 dal 5'-sito di splice Forma duplex con intron sequenze complessies con U2 Brings intron 5'-sito di splice close to branchPuntiforme ? Catalytic attività Collegamenti to spliceosomes: Detailed meccanismi Swarthmore (Non updated) Arizona Animated gifs Sintesi Meccanismo

splicing pre-mRNA U1 lega a 5' sito di splice U2 lega a branchPuntiforme riconoscimento sequenza U4-U5-U6 complessi lega a 5' sito di splice   U1 è displaced U6 lega a U2 5'-sito di splice vicino branchPuntiforme   U5 lega esone sequenze Introne è removed

splicing pre-mRNA: Umano Malattias²

• Splicing elemento tipi disrupted
  • cis-elemento
    • Colpisce espressione di una singolo gene
    • Can colpite use of constitutive o alternative Siti splice
    • Distrutta constitutive splicing: La maggior parte di spesso Risultano nei perdita di gene espressione dovuta a aberrant splicing
    • Inattivazione o attivazione of alternatively usata Siti splice
      • Può force espressione un splicing alternativo Modello: Natural mRNA è espresso
      • Ma espressione nei inappropriate tessuto o sviluppomental stage might result nei malattia
  • trans effetto
    • Cambiamenti multipla geni
    • Distruzione tipi
      • Malattie of basal splicing machinery
      • Malattie of splicing regolazione
• mRNA tipi prodotto
  • Espressione of unnatural mRNAs: Aberant splicing creates unnatural splicing modelli
  • Inappropriate espressione of natural mRNAs: Distrugge use of alternatively usata Siti splice

• Cis effetti: Mutazioni that distrutto use of alternative Siti splice
  • Familiare isolati crescita ormoni Carenza tipo II: Bassa statura
    • Mutazioni cause aumentati splicing alternativo dell'esone 3
    • Meccanismo: Distruzione un of tre splicing elements, ISE, ESE, o 5' sito di splice
  • Frasier sindrome: Mutazioni inactivate 5' sito di splice, resulting nei shift of Isoforme
  • Frontotemporal demenza e Parkinsonismo collegate to Cromosoma 17 (FTDP-17)
    • Meccanismo: La maggior parte di mutazioni alter regolatore elemants; Cause malattia by l'aumento inclusione dell'esone 10 of MAPT gene
  • Atipica fibrosi cistica
    • Polimorfismi nell'introne 8 colpite splicing dell'esone 9: Variabile malattia manifestazioni
• Trans effetti: Mutazioni that colpite basal splicing machinery
  • Retinite pigmentosa
    • Dominante RP sindromi: PRPF31; HPRP3; PRPC8
    • Genes coinvolti nei funzione of U4/U6 · U5 tri-snRNP
  • Atrofia muscolare spinale
    • SMN2 gene does non completamente compensate per la perdita di SMN1 funzione
      • Uno nucleotide sostituzione distrugge un ESE nell'esone 7: Causa esone 7 a be skipped nei maggior parte SMN2 mRNAs
    • SMN1 è un assembler of SnRNP complessies
      • U1, U2, U4, e U5 snRNPs
      • SMN è richiede per the citoplasmatiche assembly della snRNPs
• Trans effetti: Mutazioni that colpite regulators of splicing alternativo
  • Distrofia miotonica: DM1; DM2
    • RNAs con lunga tracks of CUG o CCUG ripetizioni sono trascritte dal espanse DMPK e ZNF9 alleles
    • Repeat-contenente RNAs accumulate nei discrete nucleari foci
    • Expanded RNA ripetizioni: Disrupt funzione of RNA-proteina di legame
      • CUG-BP: Può essere associata con disrupted RNA processing of cTNT, IR e ClC-1
      • Muscoliblind: Associata con nucleari foci
    • 5 pre-mRNAs undergo aberrantly regolata splicing nei DM1: SwItch to embryonic Modello
      • Cardiaco troponin T (cTNT): ? Correlata a cardiaca malattia
      • Insulin recettore (IR): inferiori signalling isoForm; Correlate con insulina resistenza nei DM
      • Muscoli-specifico chloride canale (ClC-1): Perdita di funzione; Probabilmente correlate a miotonia nei DM
      • Tau
      • Miotubularina-relativa 1
  • Neoplasmia